国内外研究显示，在不孕不育夫妇中，衣原体检出率明显高于生育组，患有不孕症的妇女中有40%可检查到衣原体，沙眼衣原体感染是导致不孕的重要原因。由于沙眼衣原体感染初期无明显自觉症状，从而容易延误治疗，导致生育能力损害。
为什么衣原体会导致不孕？
在妇科门诊、不育门诊，通常会检查衣原体，不论是抽血检查衣原体IgG抗体，或是阴道内取宫颈分泌物等，都是想确认体内是否存在衣原体感染，以免造成输卵管盆腔慢性炎症而不自知。尤其是输卵管的水肿与阻塞，直接造成精子和卵子无法相遇，子宫外孕机率增加，或是子宫内胚胎困难着床的大问题。
孕妈若是衣原体阳性没有积极治疗，会造成新生儿出生时，发生母子垂直感染的可能，有些新生儿会被感染到结膜炎，严重的新生儿甚至会造成失明，还有部分宝宝有衣原体肺炎的风险。
男性感染衣原体之后，会有少量尿道口分泌物，以及轻微排尿不适，长时间造成慢性附睾炎最终导致男性不孕。
孕妇感染沙眼衣原体对胎儿或新生儿会有什么影响？
如果孕妇为生殖道沙眼衣原体感染者，且未接受治疗，可能会造成流产或者将衣原体传染给新生儿。新生儿通过母体产道时可发生眼部、咽喉、阴部等部位感染，引起新生儿衣原体结膜炎、鼻炎、中耳炎、肺炎和女婴阴道炎。新生儿衣原体感染首先体现为结膜炎，多于出生后5~12天发病，结膜充血，有黏脓性分泌物，严重者可失明。
另外，比较常见的是婴儿沙眼衣原体性肺炎，体现为反复发作的阵咳和呼吸急促，发病缓慢，伴有低热，常规抗生素治疗无效。此外，还有新生儿泌尿道、咽部及直肠沙眼衣原体感染，可能会持续到患儿1岁以后。因此，应对孕妇产前常规筛查沙眼衣原体，如果存在感染应积极治疗，以防止不良并发症的发生。
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